Действие аниме разворачивается вокруг старшеклассника Дзюмпэя Манаки, который мечтает стать режиссёром. Однажды на крыше школы он сталкивается с таинственной девушкой, но она скрывается раньше, чем он успевает её рассмотреть. Единственное, что остаётся в его памяти — это клубничные трусики. На крыше Дзюмпэй находит тетрадь, принадлежащую скромной и талантливой писательнице Ае Тодзё. Несмотря на то, что она не похожа на ту девушку с крыши, они быстро находят общий язык и становятся друзьями, разделяя мечту создать отличный сценарий и снять по нему фильм.
Между тем, Дзюмпэй начинает подозревать, что та самая «клубничка» — это Цукаса Нисино, самая популярная девушка в школе. Однажды она случайно упоминает о своём клубничном белье, что только усиливает его подозрения. Не колеблясь, Дзюмпэй делает неожиданное предложение Цукасе — встречаться. Его дерзость шокирует всех, но Цукаса неожиданно соглашается, и их отношения становятся предметом обсуждения всей школы.
Тем временем, Ае Тодзё, которая тайно влюблена в Дзюмпэя, наблюдает за его отношениями с Цукасой с грустью. Она продолжает работать над сценарием, надеясь, что это поможет ей привлечь внимание Дзюмпэя. В этой сложной любовной драме каждый персонаж ищет своё место, сталкиваясь с трудностями и разочарованиями. Аниме «Клубника 100%» показывает, как первые шаги к мечте могут быть переплетены с первыми шагами в любви, создавая незабываемый и трогательный сюжет.